يعتبر تخصص هندسة الميكاترونيكس في جامعة الطفيلة التقنية برنامجًا شاملاً يجمع بين الهندسة الكهربائية، الميكانيكية، والهندسة الحاسوبية. يهدف إلى تأهيل الطالب لفهم وتحليل وتصميم أنظمة تحكم ذكية تجمع بين الأجهزة الميكانيكية والإلكترونية وبرمجيات التحكم. تشمل المواد الأساسية الرياضيات، الفيزياء، الإلكترونيات، البرمجة، التحكم المنطقي، والروبوتات. تأسس القسم ضمن كلية الهندسة في عام 2005، ويُعد من البرامج الحديثة نسبياً التي تعكس الطلب المتزايد على المهندسين القادرين على تحويل الأفكار إلى أنظمة فعالة ومتكاملة .يوفر التخصص تعليمًا نظريًا وعمليًا في مختبرات متقدمة تشمل الأتمتة الصناعية، أنظمة التحكم، والمحاكاة.