برنامج هندسة الطاقة يركّز على دراسة مصادر الطاقة التقليدية والمتجددة، مع تركيز قوي على كفاءة الطاقة والتقنيات المستدامة. يشمل مواداً متقدمة في الرياضيات، انتقال حرارة، ميكانيكا الموائع، أنظمة الطاقة الشمسية والرياح، الخلايا الكهروضوئية، وأنظمة محطات الطاقة الحرارية. أُطلق البرنامج في بداية الفصل الثاني من العام الأكاديمي 2014/2015 لتلبية الاحتياجات المتزايدة في الأردن والمنطقة، وسرعان ما بدأت أول دفعة في التخرج عام 2020.

يتمتع التخصص بطابع عملي قوي، إذ يوفر مختبرات محاكاة، طاقة شمسية، طاقة الرياح، انتقال حرارة، ومحركات احتراق داخلي. البرنامج يُهيئ خريجين لإيجاد حلول مبتكرة تقلل الاعتماد على الطاقة التقليدية وتعزز التنمية المستدامة.